マイクロアレイを用いた遺伝子発現解析サービス
アジレント・テクノロジー社製マイクロアレイによる
遺伝子発現解析を行います。
マイクロアレイ
アジレント・テクノロジー社製 遺伝子発現解析用マイクロアレイ
1枚のスライドに4つのアレイを搭載
1つのアレイあたり約44,000個のプローブを搭載
Whole Human Genome
オリゴDNAマイクロアレイキット
カタログ#G4112F（5スライドセット）
Whole Mouse Genome
オリゴDNAマイクロアレイキット
カタログ#G4122F（5スライドセット）
1枚のスライドに8つのアレイを搭載
1つのアレイあたり約60,000個のブローブを搭載
SurePrint G3 Human GE
マイクロアレイキットver3.0
カタログ#G4851C（3スライドセット）
SurePrint G3 Mouse GE
マイクロアレイキットver2.0
カタログ#G4852B（3スライドセット）
上記以外のマイクロアレイに関しましては、ご相談ください。
ラベリング試薬
アジレント・テクノロジー社製 Low Input Quick-Amp Labeling Kit（1カラー用）
カタログ#5190-2305
アジレント・テクノロジー社製 Quick-Amp Labeling Kit（1カラー用）
カタログ#5190-0442
マイクロアレイやラベリング試薬の仕様などに関しましては
アジレント・テクノロジー社サイトにてご確認下さい。
- RNAをご送付いただいてから解析結果報告までの日数はサンプルの数、RNA抽出作業やデータ解析などの作業内容により変動いたします。
- ご依頼前相談の際に、所用日数と費用の概算を御連絡いたします。
- 解析データはDVD-ROMに記録して納品いたします。
- 解析データの内容は、ご依頼内容によって異なります。
遺伝子発現解析フロー
サンプル数やアレイ数などについてご依頼前に相談いたします。また所用日数や費用の概算もご連絡いたします。
解析に使用するサンプルはトータルRNAです。
血液、細胞、組織から抽出したものを使用することができます。
ベクトン・ディッキンソン社製パクスジーンRNA採血管の場合は、弊社にRNA抽出作業も合わせてご依頼可能です。
吸光度計による測定とアジレント・テクノロジー社製バイオアナライザ2100による電気泳動によるトータルRNAの品質チェックを行います。
アジレント・テクノロジー社の実験プロトコールに従ってラベリング反応からハイブリダイゼーション、スキャン及び数値化データの取得までを一貫して行います。
アジレント・テクノロジー社製ソフトウェアGeneSpring GXでの解析をご希望の場合は、合わせて弊社にご依頼可能です。（オプションとなります。）
アレイのスキャン画像、数値化データなどをDVD-ROMに記録して納品いたします。
サンプル
トータルRNAは血液、細胞、組織から採取したものを使用することができます。弊社に到着後、吸光度測定、電気泳動にて品質の確認をいたします。
発送していただくトータルRNA量は1ug以上（50ng/μl以上）でお願いいたします。トータルRNAはNuclease Free Waterに溶解し、冷凍状態でご送付ください。
なお、ベクトン・ディッキンソン社製パクスジーンRNA採血管をご使用の場合は、弊社にトータルRNAの抽出作業からご依頼可能です。
GeneSpring GXでの解析（オプション）
アジレント・テクノロジー社製ソフトウェアGeneSpring GXにて以下の解析を行います。
- 正規化（ノーマライズ）
- 有効プローブ抽出（データフィルタリング）
- データQC（クオリティコントロール）
- 発現変動遺伝子の抽出
- Gene Ontology解析
- Network解析など
- Rawデータ、スキャン画像や解析結果などはDVDROMに記録して納品いたします。